Le musée est géré par la fondation Alekos Fassianos. L’objectif premier est de faciliter la recherche sur l'œuvre du créateur en ouvrant le dialogue avec d'autres artistes, chercheurs, conservateurs mais surtout avec le public au sens large. Grâce à une approche interdisciplinaire, le musée accueille aussi des expositions temporaires et organise des événements pédagogiques en collaboration avec des institutions culturelles. Décoré par l'Académie d'Athènes, Fassianos était également membre d'honneur de l'Académie Russe des Arts, ainsi que Commandeur d'Ordre des Arts et des Lettres de la Légion d'Honneur.